More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1171 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  88.1 
 
 		 279 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  82.27 
 
 		 281 aa  481  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  80.94 
 
 		 276 aa  474  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  78.76 
 
 		 272 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  75.97 
 
 		 268 aa  417  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  74.03 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  53.67 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  54.05 
 
 		 272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  52.51 
 
 		 265 aa  305  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  52.44 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  36.97 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  36.97 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  35.11 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  34.73 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.61 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.84 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.2 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  23.41 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.2 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.63 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  24.41 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.85 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  25.75 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.28 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.28 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.93 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.46 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.28 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  24.91 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  23.65 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  24.06 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.91 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  34.43 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.91 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  24.28 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.69 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  21.86 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.46 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.32 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  33.04 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  24.8 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.15 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.33 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  21.6 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  21.43 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  22.75 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>