More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01577 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  92.24 
 
 
245 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  80.23 
 
 
272 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  69.81 
 
 
265 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  55.56 
 
 
261 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  56.63 
 
 
268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  53.64 
 
 
279 aa  310  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  55.17 
 
 
276 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  54.79 
 
 
281 aa  307  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  53.67 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  53.99 
 
 
272 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  36.18 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  36.18 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  35.18 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  35.18 
 
 
279 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.19 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27.06 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.67 
 
 
261 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.71 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.31 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.59 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.67 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.3 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  26.62 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.8 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  22.1 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  24.11 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  22.35 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  25.57 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  23.44 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.57 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  24.18 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  23.68 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  20.72 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  24.15 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  24.18 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  23.55 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  25.47 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.1 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  23.28 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  25.87 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  22.31 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  24.72 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  22.62 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  21.77 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
621 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  21.43 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  35.35 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.21 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  22.57 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1788  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000383201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.79 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1813  alpha/beta fold family hydrolase  22.8 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1989  hydrolase, alpha/beta fold family  22.8 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1399299999999999e-49 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>