More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1328 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  100 
 
 		 272 aa  568  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  80.23 
 
 		 267 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  82.57 
 
 		 245 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  66.42 
 
 		 265 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  60.08 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  55.21 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  56.2 
 
 		 276 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  56.59 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  54.05 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  55.04 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  54.05 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  33.6 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  33.73 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  33.73 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.01 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.01 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.29 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.84 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.41 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.02 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.79 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  23.37 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  22.53 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  25.56 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  25.56 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  25.69 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.94 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  23.44 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.1 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.63 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.94 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.29 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.29 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  22.78 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.56 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.53 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  26.32 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.34 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.47 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  22.64 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  22.54 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  21.24 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.02 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.6 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>