More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0434 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  98.57 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  36.74 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  36.09 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  35.18 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.6 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  33.97 
 
 		 265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  34.44 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 271 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  20.74 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.53 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.45 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.21 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  20.78 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  21.65 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  21.76 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  20.08 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  20.56 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  21.18 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.87 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.37 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.17 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  23.22 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.37 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.37 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  21.53 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  22.93 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25.21 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  20.56 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  22.48 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  25.28 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  22.64 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  21.85 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.21 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.07 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  27.35 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24.37 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  23.98 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  23.3 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.51 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  20.4 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.48 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  22.47 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  24.44 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1788  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000383201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  20.8 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  20.24 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.23 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  22.51 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  27.78 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  20.4 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  20.4 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  21.2 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  21.2 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  21.2 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  24.53 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  20.9 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>