More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0913 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  100 
 
 
265 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  69.81 
 
 
267 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  66.42 
 
 
272 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  69.96 
 
 
245 aa  377  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  52.51 
 
 
278 aa  305  6e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
268 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  51.74 
 
 
279 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  52.51 
 
 
281 aa  297  9e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
272 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  50.57 
 
 
276 aa  289  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  50.19 
 
 
261 aa  285  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  34.22 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  33.97 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  34.38 
 
 
257 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  34.38 
 
 
257 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  23.33 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  22.48 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  21.45 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.2 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.54 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.05 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.1 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  23.92 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
621 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.96 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  22.15 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.81 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.7 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  23.85 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  25.75 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.95 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  22.3 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  23.74 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  23.74 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  23.74 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  24.06 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  21.4 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  23.28 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.29 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  22.96 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  24.62 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  22.83 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  23.65 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  21.64 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.29 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  23.85 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  23.22 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  20.75 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  23.44 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  24.24 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.71 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  24.08 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2038  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0252314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  24.73 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  22.81 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  30.56 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  20.96 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>