More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1088 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
261 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  72.87 
 
 
276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  73.64 
 
 
279 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  74.03 
 
 
281 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  74.03 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  69.35 
 
 
268 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  69.08 
 
 
272 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  55.56 
 
 
267 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  55.04 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  54.39 
 
 
245 aa  290  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  50.19 
 
 
265 aa  285  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  36.47 
 
 
279 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 
257 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 
257 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  36.09 
 
 
279 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.26 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  21.97 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25.26 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.56 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  24.44 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  23.59 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.78 
 
 
368 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25.65 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.62 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.86 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.78 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  24.44 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.1 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.1 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  23.47 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.71 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  24.11 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.49 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  24.8 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.39 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.7 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25.72 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  25.58 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.49 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  23.4 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  21.13 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  24.8 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.78 
 
 
371 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.5 
 
 
371 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.5 
 
 
371 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  23.72 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  32.35 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  35.78 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  20.65 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  24.31 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  24.31 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
360 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3424  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  36.9 
 
 
110 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0549007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>