More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1158 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  85.66 
 
 
279 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  80.94 
 
 
278 aa  474  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  78.65 
 
 
281 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  75.58 
 
 
268 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  74.81 
 
 
272 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  72.87 
 
 
261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  56.2 
 
 
272 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  55.17 
 
 
267 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  54.96 
 
 
245 aa  298  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  50.57 
 
 
265 aa  289  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  36.44 
 
 
257 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  36.44 
 
 
257 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  37.12 
 
 
279 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  36.74 
 
 
279 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.81 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.3 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.29 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25.46 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.73 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  23.46 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.36 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  22.1 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  24.83 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  24.73 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  24.83 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  25.46 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.83 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  24.83 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  24.83 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  24.83 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.2 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.08 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  35.25 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.69 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.09 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.3 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.26 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.3 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.84 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.63 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.83 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  24.33 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.15 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  27.38 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  22.89 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  23.14 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  23.05 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  37.84 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  37.84 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.62 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.22 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  22.53 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  22.89 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>