More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3415 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 256 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  58.33 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.58 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  32.23 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  35.98 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.02 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  34.8 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.41 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 346 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 315 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  30.87 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.98 
 
 		 279 aa  85.1  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  32.39 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.68 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.72 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  31.85 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.21 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.36 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.36 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.58 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.59 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  29.88 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.72 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>