More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01012 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  100 
 
 
266 aa  543  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
266 aa  543  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  543  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  98.5 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  98.5 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  98.5 
 
 
266 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  97.74 
 
 
266 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  97.74 
 
 
270 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  75.29 
 
 
270 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  48.54 
 
 
259 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  45.75 
 
 
259 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  47.39 
 
 
266 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
260 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  43.03 
 
 
278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
260 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
265 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 
261 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  22.44 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.32 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.64 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  25.31 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.61 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.35 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.38 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.19 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.78 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  26.56 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.31 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  24.1 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  22.01 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  22.01 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  21.23 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.45 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.51 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>