More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4748 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  83.28 
 
 
288 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  82.93 
 
 
287 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  82.93 
 
 
287 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  82.58 
 
 
287 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  82.58 
 
 
288 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  57.8 
 
 
293 aa  353  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  43.06 
 
 
287 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  38.03 
 
 
292 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
304 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 
299 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  41.08 
 
 
316 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
299 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
288 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  32.99 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
288 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
289 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
361 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
281 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
273 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
279 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
350 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 
275 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
299 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
298 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
299 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
299 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
302 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
345 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.15 
 
 
291 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
316 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  31.46 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
283 aa  92  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  31.37 
 
 
289 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  30.21 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
285 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
285 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
285 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.89 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.25 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
275 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
340 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
372 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
273 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
333 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
346 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.3 
 
 
371 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.3 
 
 
371 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
226 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 
263 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>