More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3803 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  48.84 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
283 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  30.35 
 
 
275 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  35.55 
 
 
261 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
502 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 
275 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
275 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
275 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  29.46 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  32.82 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 
263 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 
286 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.82 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  34.87 
 
 
263 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
262 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
268 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  34.75 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.14 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
279 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  34.36 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  34.36 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
264 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
284 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
277 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 
292 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
270 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.8 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.84 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.87 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.04 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.42 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.42 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.42 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.24 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.42 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
277 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.76 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.93 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.93 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.49 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.95 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.28 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  30.49 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.02 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.87 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.28 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  32.2 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>