More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  58.44 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  47.08 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  46.03 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  42.24 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  42.37 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.08 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.47 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  36.97 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.87 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.87 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.87 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  33.33 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.74 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  42.39 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.73 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.29 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.29 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  39.25 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  29.32 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.03 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2894  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.68 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.05 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  36.96 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.57 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  39.56 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  25.27 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  28.33 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  35.24 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.16 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.51 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 335 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.6 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  21.81 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5351  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.81 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>