More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2045 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
243 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  43.28 
 
 
247 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  34.02 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1755  hydrolase or acyltransferase  32.08 
 
 
258 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1776  hypothetical protein  32.08 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1733  hydrolase or acyltransferase  32.5 
 
 
258 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0207181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1914  hypothetical protein  32.08 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0234927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  32.49 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
262 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0050  hypothetical protein  27.39 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 
253 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0532502  normal  0.345271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  31.45 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.89 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  30.25 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  24.9 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
352 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 
326 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  26.14 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  26.14 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  26.14 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.88 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
298 aa  62.4  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.97 
 
 
301 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
277 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  37.37 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
296 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  30.12 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  23.51 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  34.34 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
339 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.05 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.56 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.74 
 
 
320 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.19 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
278 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
368 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
269 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
281 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
344 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
308 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
267 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
287 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
298 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  34.34 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.61 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.48 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  22.54 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
342 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  33.93 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>