More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0222 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  84.69 
 
 		 294 aa  510  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  36.64 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.08 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 327 aa  86.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  38.98 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.51 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  31.67 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.75 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.06 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.4 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.4 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.29 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.64 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  34.23 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  38.26 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  35.2 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  24.27 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  37.9 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  26.57 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 562 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>