211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1525 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  39.74 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  33.04 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.47 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  35 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.47 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  34.05 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.91 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.14 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1755  hydrolase or acyltransferase  31.13 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1822  alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.230718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1776  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1914  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0234927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  35.42 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1813  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1788  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000383201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  23.94 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1770  alpha/beta fold family hydrolase  24.53 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.841886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1953  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00974943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  23.36 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1989  hydrolase, alpha/beta fold family  24.64 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1399299999999999e-49 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  35.71 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2038  alpha/beta fold family hydrolase  23.94 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0252314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2449  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00496811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2171  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0619801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  23.7 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  35.16 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  27.57 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 284 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  33.98 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  26.03 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  24.17 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  26.92 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11771  Alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  37.25 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2435  hydrolase, alpha/beta fold family  23.35 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  23.35 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  25.88 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.36 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  28.57 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.08 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  29.17 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  21.14 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 317 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>