More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5049 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  43.28 
 
 
243 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  30.2 
 
 
260 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  34.69 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1755  hydrolase or acyltransferase  33.06 
 
 
258 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1776  hypothetical protein  33.06 
 
 
258 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1733  hydrolase or acyltransferase  31.4 
 
 
258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0207181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1914  hypothetical protein  33.06 
 
 
258 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0234927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1270  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
262 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273364  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0050  hypothetical protein  27.71 
 
 
251 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  29.66 
 
 
259 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0532502  normal  0.345271 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.85 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  32.38 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  32.38 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  32.38 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  32.38 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
405 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.9 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
310 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  22.61 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
287 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  23.6 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 
456 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.84 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  29.45 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  37.39 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
291 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
327 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
302 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
321 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
329 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
291 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
298 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  37.25 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  33.64 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  34.65 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  36 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03008  hypothetical protein  22.94 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
301 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
311 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  36.26 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
293 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
289 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  30.19 
 
 
265 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.7 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
339 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
340 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 
425 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
340 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
340 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>