More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3109 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
290 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  36.9 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
408 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
408 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
408 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  28.78 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
282 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 
290 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
324 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  24.12 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.74 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3872  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.51 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.493691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  26.51 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.4 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  30.77 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.71 
 
 
341 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.25 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.83 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.29 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.29 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
323 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
292 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.36 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  33.03 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.36 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.75 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>