More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1827 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  100 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  35.9 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  34.71 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  33.46 
 
 		 408 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  30.77 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.15 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  29.63 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  26.81 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.89 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  29.71 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  26.06 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2389  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0360603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  41 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 330 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  33.33 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  39.32 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  32.96 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  33.33 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  31.48 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  30.84 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  37.14 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  33.7 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  30.56 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.35 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  29.91 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 381 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  33 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  40.71 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>