98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1006 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
324 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  61.3 
 
 
330 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  41.43 
 
 
323 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
310 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
297 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  29.31 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  30.92 
 
 
290 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  26.6 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  21.55 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  25.72 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  21.99 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  31.49 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 
303 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.47 
 
 
372 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
268 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.77 
 
 
263 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.62 
 
 
380 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  35.71 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 
270 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.68 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
248 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  34.48 
 
 
270 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 
284 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 
312 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.44 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  29.23 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  32.76 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  32.76 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.08 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  32.76 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  31.9 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  30.69 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.54 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  22.53 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  32.31 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  30.69 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.08 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
254 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  31.9 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  27.52 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.46 
 
 
236 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  30.7 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
263 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  27.61 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.62 
 
 
371 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 
276 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.09 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.62 
 
 
371 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
235 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.85 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>