More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4023 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
282 aa  541  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
408 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
408 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  35.37 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
408 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  36.98 
 
 
408 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
306 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  34.63 
 
 
290 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
299 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  35.68 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  43.9 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.94 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  44.34 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.51 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.24 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.24 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.94 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.06 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.19 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.19 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.19 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.32 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.57 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  36.97 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.52 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.04 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.12 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  26.51 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.07 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.37 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.37 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.58 
 
 
371 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 
293 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
361 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  34.51 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
293 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  39.05 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36 
 
 
380 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
350 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.17 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.36 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  36.21 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  30.15 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  37.63 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  21.93 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
581 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>