More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4236 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
301 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  70.83 
 
 
296 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  70.49 
 
 
296 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  68.8 
 
 
301 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  64.16 
 
 
301 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  63.82 
 
 
301 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  63.82 
 
 
301 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  63.82 
 
 
301 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  63.82 
 
 
301 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  63.82 
 
 
301 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  63.39 
 
 
303 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  64.09 
 
 
298 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  64.43 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  62.05 
 
 
303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  62.05 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  62.3 
 
 
305 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  62.3 
 
 
305 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  62.3 
 
 
305 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  44.2 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 
284 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
296 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
300 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 
300 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 
298 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
272 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  40.26 
 
 
284 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
265 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  34.23 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.24 
 
 
369 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.22 
 
 
571 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.56 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.6 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  20.54 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.3 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.35 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.41 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.68 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  30.65 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  26.02 
 
 
510 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.45 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.34 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.8 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.53 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.78 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
393 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  33.59 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  28.68 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.62 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  37.98 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.16 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 
371 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.16 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.76 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>