More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4507 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  59.06 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  45.36 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  43.6 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  42.86 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  43.01 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  41.02 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  42.91 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  42.91 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  42.91 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  42.91 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  42.91 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  42.55 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  43.17 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  44.4 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  26.55 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.48 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  26.79 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  28.24 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  32.76 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.1 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.59 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  41.51 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.62 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.17 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  35.51 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.17 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  33.64 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  29.09 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  29.09 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>