More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3568 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  58.43 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  48.97 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  43.53 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  41.76 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  43.33 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  43.93 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  41.04 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  38.39 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  31.45 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  31.45 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  30.95 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  34.09 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  32.98 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.03 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  27.01 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2766  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  42.31 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  40 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  36.54 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5478  Alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.13 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.58 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  33.81 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2389  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0360603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  31.87 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.24 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  31.87 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.66 
 
 		 370 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 353 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  24.33 
 
 		 453 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  28.77 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>