More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4100 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  98.68 
 
 
303 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  92.08 
 
 
298 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  87 
 
 
298 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  92.79 
 
 
305 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  92.79 
 
 
305 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  92.79 
 
 
305 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  64.33 
 
 
296 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  71.85 
 
 
301 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  71.85 
 
 
301 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  71.85 
 
 
301 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  72.19 
 
 
301 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  73.01 
 
 
301 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  72.19 
 
 
301 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  71.85 
 
 
301 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  64.33 
 
 
296 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  71.38 
 
 
303 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  62.05 
 
 
301 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  48.93 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
298 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  43.22 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  44.8 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  44.54 
 
 
284 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
282 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
265 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
253 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  33.6 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.73 
 
 
282 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.44 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30.56 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.34 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.62 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  32.18 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.05 
 
 
248 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.51 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.46 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.56 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  29.25 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.98 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.5 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.41 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  32.22 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.35 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.06 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.82 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  26.84 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.06 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.39 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.33 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  28.09 
 
 
389 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  30.86 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  35.51 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
265 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  41 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>