More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1310 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  98.68 
 
 
301 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  98.68 
 
 
301 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  98.68 
 
 
301 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  98.68 
 
 
301 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  98.68 
 
 
301 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  99.01 
 
 
301 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  89.04 
 
 
301 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  73.67 
 
 
298 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  71.05 
 
 
303 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  72.76 
 
 
298 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  71.38 
 
 
303 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  65 
 
 
296 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  63.33 
 
 
296 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  63.39 
 
 
301 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  72.13 
 
 
305 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  72.13 
 
 
305 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  72.13 
 
 
305 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  49.47 
 
 
291 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  43.89 
 
 
298 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  47.58 
 
 
284 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  42.22 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  39.63 
 
 
272 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
296 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  43.72 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
282 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  34.54 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  34.31 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.12 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.37 
 
 
370 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.7 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.88 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.79 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  45.13 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.67 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
581 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.89 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  29.2 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.4 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.88 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.23 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  30.31 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.24 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.69 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.68 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.12 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  25.7 
 
 
510 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>