More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6254 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  71.37 
 
 		 281 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  69.47 
 
 		 281 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  60.77 
 
 		 278 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  49.01 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  41.67 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  35.8 
 
 		 292 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  36.4 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  34.59 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  36.33 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.92 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.92 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.75 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.3 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.59 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.82 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.68 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.39 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  28.45 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.14 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  23.77 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.67 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.71 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.32 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  25.3 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.75 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>