More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7062 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  91.55 
 
 		 296 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  70.49 
 
 		 301 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  66.08 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  64.33 
 
 		 303 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  64 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  64.09 
 
 		 301 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  63.73 
 
 		 298 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  63.76 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  63.76 
 
 		 301 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  63.76 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  63.76 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  63.76 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  65.42 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  63.33 
 
 		 303 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  48.6 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.77 
 
 		 397 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.1 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 		 393 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  34.03 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  25.58 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.16 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  31.84 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.32 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.35 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.84 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.12 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.03 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.63 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  27.09 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  35.77 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.25 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  40.69 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  27.38 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  28.23 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.32 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.23 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  37.25 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  28.23 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.23 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.22 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>