More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3024 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
273 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
267 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
275 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
268 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 
404 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 
257 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 
287 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
290 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  33.46 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
298 aa  92  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
287 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
380 aa  85.5  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  33.07 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.67 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.67 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.5 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.58 
 
 
372 aa  82  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.09 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.31 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.13 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3221  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000558124  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13370  hypothetical protein  31.98 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.34 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  28.4 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.68 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.23 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.71 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.68 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.64 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.27 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.38 
 
 
368 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.38 
 
 
368 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  33.59 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.18 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.31 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.48 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.38 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  34.04 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  32.75 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.37 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.1 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  45.74 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.06 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.66 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11771  Alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  44.66 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  46.02 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.92 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.29 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  45.13 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  45.13 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  45.13 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3600  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  21.57 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.78 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  45.13 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  45.13 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14941  Alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0521265  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.44 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>