More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4874 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
277 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  59.35 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  60.9 
 
 
284 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  60.67 
 
 
284 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  60.9 
 
 
284 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13370  hypothetical protein  54.75 
 
 
248 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
266 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  43.64 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.15 
 
 
369 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.62 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  28.68 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
346 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.94 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.65 
 
 
328 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  27.9 
 
 
298 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  26.72 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.56 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.28 
 
 
372 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
352 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.65 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
312 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
340 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
314 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
340 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.36 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
340 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
260 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.36 
 
 
270 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
294 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  32.97 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.98 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.2 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  34.62 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.36 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.2 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.93 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>