More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0581 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  48.89 
 
 
268 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 
404 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  46.56 
 
 
257 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
273 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
290 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 
286 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 
265 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
257 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
273 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
329 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
266 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
298 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
287 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.17 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
340 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.63 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.71 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.71 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3221  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000558124  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.8 
 
 
374 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.54 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  44.57 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.62 
 
 
371 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.28 
 
 
313 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.62 
 
 
371 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
370 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.5 
 
 
369 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
344 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
335 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  36.96 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.82 
 
 
562 aa  62.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 
370 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
346 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.9 
 
 
370 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
339 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.27 
 
 
343 aa  62.4  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
330 aa  62.4  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>