More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3221 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3221  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
273 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000558124  normal  0.0180053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 
273 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
290 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.52 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.11 
 
 
372 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.33 
 
 
372 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.91 
 
 
371 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.91 
 
 
371 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.94 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.7 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.19 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.67 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.19 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
363 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  31.62 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  21.57 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  26.07 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.64 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  26.07 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  26.07 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.61 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.13 
 
 
371 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.96 
 
 
370 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  41.28 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  26.42 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.18 
 
 
370 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.63 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.9 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  21.27 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
437 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.41 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  21.57 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  20.78 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
312 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  34.58 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.29 
 
 
389 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.85 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.85 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.45 
 
 
367 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
314 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
339 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  45.65 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>