More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1697 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  100 
 
 
298 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  93.62 
 
 
298 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  71.93 
 
 
300 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  72.01 
 
 
302 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  65.51 
 
 
301 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  64.79 
 
 
301 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  64.89 
 
 
299 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  64.18 
 
 
301 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  47.9 
 
 
292 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
297 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  40.38 
 
 
288 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  30.32 
 
 
318 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  52.78 
 
 
78 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.24 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.24 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.62 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  30.14 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.52 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.8 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
390 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.36 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
588 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.62 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.84 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.24 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  28.04 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  37.76 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  37.76 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>