More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4608 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  94.65 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  94.02 
 
 		 301 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  87.71 
 
 		 301 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  72.92 
 
 		 300 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  64.79 
 
 		 298 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  64.44 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  59.06 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  38.71 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  27.18 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.62 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  44.16 
 
 		 78 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.24 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.24 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.34 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  41 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  38.02 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  39.5 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  36.55 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  31.61 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  38.66 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.58 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.35 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  41.05 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  42.71 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  27.01 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  38.78 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  37.76 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  37.76 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  26.94 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  37.76 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  38.78 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  37.76 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  37.76 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  37.76 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  36.3 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  27.14 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>