18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01213 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  100 
 
 
78 aa  163  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  49.33 
 
 
292 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  52.78 
 
 
298 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  48.05 
 
 
301 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 
302 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  52.78 
 
 
298 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  46.75 
 
 
299 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  49.33 
 
 
300 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 
301 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  52.38 
 
 
295 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
297 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  26.92 
 
 
288 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
303 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
297 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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