More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3192 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  98.88 
 
 		 267 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  94.36 
 
 		 271 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  93.23 
 
 		 271 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  92.86 
 
 		 271 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  92.11 
 
 		 271 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  55.68 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  57.79 
 
 		 272 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  58.17 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  57.41 
 
 		 272 aa  294  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  47.35 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  43.94 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.76 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 361 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.72 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  24.65 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.4 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  43 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.39 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  27.38 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  31.27 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.75 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  24.14 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  24.14 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  25.98 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  24.91 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.19 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.14 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.19 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.74 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>