More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2782 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
325 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  94.08 
 
 
330 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  58.16 
 
 
350 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  51.56 
 
 
311 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 
311 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  53.55 
 
 
354 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  49.53 
 
 
332 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  53.96 
 
 
332 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  53.6 
 
 
332 aa  295  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  52.65 
 
 
332 aa  295  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  53.24 
 
 
332 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  52.52 
 
 
332 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
339 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  44.85 
 
 
390 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  45.52 
 
 
342 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  44.18 
 
 
371 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.34 
 
 
321 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
379 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
367 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
317 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  35.39 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
325 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  35.06 
 
 
317 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 
328 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
343 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  45.52 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
328 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
321 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
322 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
318 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
320 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
318 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
342 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
338 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  31.68 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
327 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.17 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32.17 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.17 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.17 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  30.91 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 
295 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
346 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
275 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
345 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
320 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
334 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  31.94 
 
 
326 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  31.94 
 
 
326 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
299 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
297 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
301 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
351 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
340 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  27.17 
 
 
335 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
278 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
287 aa  85.9  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  27.44 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>