More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5011 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 350 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  54.86 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  55.1 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  53.9 
 
 		 311 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 		 311 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  55.59 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  53.33 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  53.74 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  54.09 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 		 332 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  53.74 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  44.22 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  44.88 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  44.18 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  44.6 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  42.28 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  50.34 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  33.65 
 
 		 328 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33.44 
 
 		 317 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  31 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.38 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.39 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  27.3 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0608  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  29.35 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.4 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 302 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 340 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.25 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  38.71 
 
 		 278 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 288 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  30.18 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  30.18 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  32.03 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  25.84 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.16 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.39 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>