More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2865 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 331 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  83.99 
 
 		 331 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  83.99 
 
 		 331 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  56.57 
 
 		 346 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  55.52 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  55.41 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  44.26 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  40.47 
 
 		 329 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  34.53 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  32.68 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  34.22 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.42 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  31.33 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  31.13 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  32.78 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  31.49 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30.06 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 		 327 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.05 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  33.56 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.84 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  39.81 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1401  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.91 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  25.82 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  34.29 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>