More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0181 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
313 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.21 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.1 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.47 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.47 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.48 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  25.53 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  24.82 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  30.22 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  23.66 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.07 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.72 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  22.03 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.48 
 
 
387 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
363 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
278 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.18 
 
 
453 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 
270 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
226 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
351 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000065043  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  28.45 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  23.99 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.09 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  23.99 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  38.6 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.1 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>