More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2389 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 351 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000065043  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  57.34 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  59.59 
 
 		 337 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 		 351 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  53.04 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  48.56 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  48.52 
 
 		 355 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  45.53 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1911  alpha/beta hydrolase fold protein  46.4 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00103151  hitchhiker  0.0000592748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.19 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.19 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.19 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.71 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  42.57 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  40.19 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  32.21 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.44 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  30.3 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  32.93 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  43.81 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.64 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  29.46 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  23.98 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  36.63 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  24.85 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  34 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.24 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  33.9 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.14 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  33.76 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 226 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.92 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  32.79 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  35.24 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>