More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0689 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
353 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  92.92 
 
 
353 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  91.48 
 
 
352 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
387 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  90.91 
 
 
352 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
353 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  90.57 
 
 
353 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  85.08 
 
 
429 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  82.55 
 
 
342 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  83.44 
 
 
877 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  83.44 
 
 
439 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  83.44 
 
 
441 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  83.44 
 
 
404 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  83.44 
 
 
404 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  75.08 
 
 
387 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  69.61 
 
 
406 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  75.47 
 
 
377 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  71.99 
 
 
344 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  70.66 
 
 
348 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  71.88 
 
 
348 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  67.5 
 
 
333 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  68.93 
 
 
339 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  66.88 
 
 
333 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  69.68 
 
 
355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  62.42 
 
 
332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  63.03 
 
 
332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  62.2 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  62.39 
 
 
332 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  63.69 
 
 
332 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  64.08 
 
 
332 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  64.08 
 
 
332 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  62.38 
 
 
341 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  63.02 
 
 
335 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  62.78 
 
 
341 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  60.78 
 
 
331 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  61.02 
 
 
331 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  56.7 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  57.84 
 
 
344 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  57.24 
 
 
368 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  57.52 
 
 
344 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  51.51 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  50.83 
 
 
331 aa  333  4e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  51.16 
 
 
333 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  50.94 
 
 
381 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  48.93 
 
 
333 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 
329 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  42.73 
 
 
346 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  41.36 
 
 
330 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 
345 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 
336 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  40.25 
 
 
334 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
336 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 
343 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  38.03 
 
 
340 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
340 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
350 aa  86.3  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
280 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.73 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.56 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.6 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.27 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
290 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.6 
 
 
291 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
295 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  26.49 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.37 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  32.77 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  38.98 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>