More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4425 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
321 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
321 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
321 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 
324 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
330 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
332 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
325 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
328 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 
319 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.8 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
338 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
332 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
339 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  27.92 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.27 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.15 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  26.76 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  26.15 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  26.43 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.31 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
390 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.71 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  26.07 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  25.91 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.19 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.07 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.07 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  25.96 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.22 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
571 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.59 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
504 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.16 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>