More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09348 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  100 
 
 
331 aa  680    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  64.55 
 
 
330 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  63.09 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  59.88 
 
 
333 aa  408  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  56.91 
 
 
381 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  52.13 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  50.98 
 
 
345 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  51.63 
 
 
344 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  51.63 
 
 
344 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  51.64 
 
 
341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  51.64 
 
 
332 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  49.54 
 
 
331 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  51.8 
 
 
333 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  51.48 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  51.15 
 
 
341 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  48.18 
 
 
350 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  51.92 
 
 
344 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  50.82 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  50.82 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  50.31 
 
 
406 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  49.51 
 
 
332 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  49.53 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  49.84 
 
 
342 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  50.98 
 
 
877 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  50.83 
 
 
387 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  50.98 
 
 
404 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  50.83 
 
 
353 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  49.84 
 
 
429 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  49.51 
 
 
332 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  50.83 
 
 
353 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  50.98 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  50.98 
 
 
441 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  50.98 
 
 
439 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  50.83 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
352 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 
353 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  49.01 
 
 
348 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  47.1 
 
 
387 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  49.69 
 
 
329 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 
348 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  47.88 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  49.13 
 
 
355 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 
330 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 
345 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
336 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.29 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
343 aa  209  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
340 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
340 aa  209  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.85 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
270 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
314 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  34.32 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.4 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.79 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.79 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.9 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.24 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.65 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.9 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.21 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 
263 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  25.32 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.79 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.32 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  25.91 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.21 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  25.32 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.32 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.51 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>