More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3577 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 358 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  89.86 
 
 		 351 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  56.23 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  40.47 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  38.65 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  35.45 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  33.57 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  31.85 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  30.25 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 324 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 324 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  28.22 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.2 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 		 326 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 		 326 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 305 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.59 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 281 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.4 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  30.37 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  34.13 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  21.66 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.17 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  31.06 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>