More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2975 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1032  hypothetical protein  32.28 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.137185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1178  hypothetical protein  33 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1184  hypothetical protein  32.67 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  31.95 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.6 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4521  alpha/beta hydrolase fold protein  44.83 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  26.36 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  28.72 
 
 		 7149 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  34.78 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.69 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.87 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.72 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  30.73 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  26.69 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  32.87 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  33.07 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.93 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  23.6 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2086  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>