207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4521 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4521  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 290 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  35.92 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1032  hypothetical protein  26.74 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.137185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1178  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1184  hypothetical protein  28.68 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  43.48 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  33.15 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0532502  normal  0.345271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  33.03 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  37.65 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  27.67 
 
 		 7149 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  49.25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.9 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.03 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  33.9 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  34.78 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.88 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  53.49 
 
 		 490 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2231  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  33.12 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  39.47 
 
 		 456 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  27.01 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 		 264 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>