More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2625 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 302 aa  613  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.21 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  33.09 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  28.47 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  27.87 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 586 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  27.38 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  28.73 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  34.4 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  36.36 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.2 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  35.59 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  35.48 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  25.82 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  34.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  33.33 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  36.36 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  32.43 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  32.56 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  33.05 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  27.08 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  33.33 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  32.77 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  36.36 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  34.43 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  27.15 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  32.79 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 588 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  32.43 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.99 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1827  alpha/beta fold family hydrolase  24.45 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.95 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.6 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.52 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  34.55 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  36.14 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  33.06 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  26.64 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  28.81 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  34.55 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.6 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.6 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  32.8 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  34.75 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  34.55 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.25 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>