More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5164 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  100 
 
 
323 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  95.36 
 
 
323 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  86.07 
 
 
323 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  85.45 
 
 
323 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  85.45 
 
 
323 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  85.14 
 
 
323 aa  584  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  84.83 
 
 
323 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  82.35 
 
 
323 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  79.44 
 
 
323 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  79.13 
 
 
323 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  62.54 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  65.08 
 
 
316 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  61.39 
 
 
320 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  59.05 
 
 
323 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  58.1 
 
 
328 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  55.34 
 
 
310 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  54.95 
 
 
313 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  54.19 
 
 
310 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  56.23 
 
 
313 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  54.52 
 
 
323 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  55.02 
 
 
310 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  55.02 
 
 
310 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  55.02 
 
 
310 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  54.89 
 
 
314 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  55.63 
 
 
320 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  55.13 
 
 
326 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  55.34 
 
 
313 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  53.72 
 
 
310 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  50.79 
 
 
319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  53.4 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  55.02 
 
 
313 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  50.79 
 
 
319 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  54.31 
 
 
316 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  53.67 
 
 
316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  51.27 
 
 
320 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  52.44 
 
 
329 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  54.34 
 
 
429 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  54.34 
 
 
429 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  54.34 
 
 
429 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  54.34 
 
 
414 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  52.35 
 
 
319 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  54.02 
 
 
436 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  54.02 
 
 
312 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  54.02 
 
 
312 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  54.02 
 
 
312 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  50.64 
 
 
320 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  51.78 
 
 
321 aa  347  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  51.77 
 
 
318 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  51.27 
 
 
317 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  52.26 
 
 
326 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  51.89 
 
 
318 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  54.55 
 
 
321 aa  345  8e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
321 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  51.44 
 
 
316 aa  342  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  51.44 
 
 
342 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  50.32 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  52.24 
 
 
316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  50 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  50 
 
 
320 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
317 aa  335  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  49.69 
 
 
319 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  50.32 
 
 
317 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  50.32 
 
 
317 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  49.52 
 
 
316 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  50.32 
 
 
320 aa  329  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  51.13 
 
 
329 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  49.2 
 
 
316 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  49.2 
 
 
316 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  49.09 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  50.47 
 
 
315 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  51.58 
 
 
332 aa  326  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  49.52 
 
 
328 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  49.68 
 
 
320 aa  324  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  48.41 
 
 
333 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  48.57 
 
 
316 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  50.97 
 
 
311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  47.44 
 
 
316 aa  318  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  48.57 
 
 
316 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  47.34 
 
 
318 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  49.83 
 
 
328 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  49.04 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  46.25 
 
 
335 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  45.4 
 
 
322 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  45.22 
 
 
315 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  51.43 
 
 
316 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  45.54 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  45.86 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  48.21 
 
 
322 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  45.14 
 
 
316 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  47.1 
 
 
313 aa  297  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  47.23 
 
 
321 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  46.91 
 
 
321 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  45.31 
 
 
325 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  45.54 
 
 
319 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  48.05 
 
 
316 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  45.33 
 
 
313 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  41.56 
 
 
318 aa  287  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  48.7 
 
 
315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  43.16 
 
 
324 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>