50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0138 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
288 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  68.68 
 
 
289 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  69.75 
 
 
289 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  65.51 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.77 
 
 
295 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  30.8 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  26.33 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
304 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
586 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  30.24 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
588 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  29.8 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  28.33 
 
 
314 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 
137 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  31 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4934  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  37.3 
 
 
568 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>