217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1983 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
310 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  57.67 
 
 
304 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  57.97 
 
 
305 aa  345  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  56.86 
 
 
304 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  56.86 
 
 
304 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  56.86 
 
 
304 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 
306 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  52.9 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
309 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 
321 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 
316 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  28.23 
 
 
291 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
299 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  31.86 
 
 
308 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
294 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 
291 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
295 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
297 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  31.09 
 
 
297 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
279 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
282 aa  99  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  27.11 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  36.84 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  36.84 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  37.31 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  38.06 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  36.92 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  36.18 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.92 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  28.95 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  27.74 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  21.53 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  36.5 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  21.53 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.6 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.25 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  37.78 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  21.18 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.18 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  35.34 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 
586 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.18 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.6 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  34.62 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  32.85 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  32.85 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  21.18 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  26.62 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  31.82 
 
 
546 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  24.76 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
545 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  32.12 
 
 
323 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  31.67 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  30.77 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  25.19 
 
 
409 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01230  proline iminopeptidase  26.8 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  31.94 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>